Com a entrada da população indígena, a sustentabilidade na Floresta será afetada. Para a bióloga Flávia Biondo, a preservação da área evita a ameaça de extinção da floresta de araucária. Além disso, a floresta é importante para manter um espaço de recolonização da fauna, principalmente das várias espécies em extinção na região.

Conforme o chefe da FLONA, Adão Güllich, a preocupação é que os mais de 300 indígenas possam causar alterações nesta área de preservação. E, segundo ele, a partir do momento da declaração de terra indígena, os proprietários das áreas na região da floresta não terão indenização das terras, somente das benfeitorias, prejudicando os mais de 80 % dos agricultores familiares.

Para o analista ambiental da Flona, Remi Weirich, boa parte da floresta nativa é conservada e há uma área de plantios de araucária e de pinos. Ele destacou que a floresta é de uso sustentável e permite o manejo madeireiro na área de 300 hectares de pinos plantados, recursos disponível para a União e que pode gerar impostos para o município de Mato Castelhano.

O procurador do Estado, Rodinei Candeia, que faz parte da assessoria técnica na CPI que investiga no Congresso a atuação da Funai e do Incra na demarcação de terras indígenas e quilombolas, também participou do programa Uirapuru Ecologia. Ele destacou que ao analisar o estudo envolvendo a Flona, é visível a total impropriedade na demarcação da área.

Segundo ele, baseado na Constituição, a área da floresta nacional e o entorno não se enquadram como uma área tradicional indígena, pois nenhum índio viveu lá de acordo com os moldes da sua cultura e sobrevivência. Para ele, trata-se de uma vergonhosa manipulação grosseira, causando problemas para todas as pessoas e beneficiando terceiros, instituições e ONGS.

Na última semana um movimento de conscientização para  situação da Floresta Nacional de Mato Castelhano foi realizado com a coleta de mais de duas mil assinaturas num abaixo-assinado que será entregue ao Ministério do Meio Ambiente.